徐建国院士团队杨晶博士领衔的论文“用宏分类学方法从种的水平分析人肠道微生物群落”（Species-Level Analysis of Human Gut Microbiota With Metataxonomics）论文近日在“微生物前沿”（Frontier in Microbiology）杂志发表（https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.02029）。
迄今为止，对人肠道微生物群落的认识在分类学上基本上局限在属的水平。因此，产生了许多不正确的结论或观点，在某种程度上误导了公众。徐建国院士团队使用自己发展的细菌宏分类学方法，从“种”水平分析120个中国健康人粪便菌群，产生了许多新的知识。
他们在120个健康中国人粪便标本中发现了1235个“种水平”（SPECIES LEVEL）的细菌。其中只有461个属于已知细菌，774（62.7%）个属于未知细菌，包括358个疑似新种，和416个高分类单元。按照检出率的不同，可把1235个细菌种分为低频菌群、中频菌群和高频菌群。其中，低频菌群的检出率不到10%，中频菌群的检出率介于10%和60%之间，检出率在60%以上的属于高频菌群。高频菌群包含116个细菌种，占总测序读数的83.42%。平均每人携带186±51个细菌种。没有一种细菌是大家都有的。但是，大家共享116个细菌种，相似率为77.6%。
研究发现，在461个已知细菌种中，有166个属于潜在致病菌或条件致病菌。其中，127个属于低频菌群，28个属于中频菌群，11个属于高频菌群。几乎每个人的粪便标本，都能够检出条件致病菌。包括肺炎链球菌、脆弱拟杆菌等。
他们发现，中国人的肠道菌群可分为两型，分别以科普里普氏菌（Prevotella copri）和普通拟杆菌（Bacteroides vulgatus）为代表，简称P型和B型。北方人P型较多，南方人B型较多。
研究发现长双歧等益生菌不是肠道优势菌群，只有不到10%的人群携带这些益生菌，且数量很低。
